U.S.S. Kelvin zachytává anomálii, která vypadá jako „bouře ve vesmíru“. Záhy jí prolétá nesmírně mocná romulanská loď Narada, jejíž kapitán Nero z nějakého důvodu hledá Vulkánce jménem Spock. První důstojník George Kirk zachránil posádku za cenu nejvyšší a jeho synové tak v této časové linii vyrůstají bez otce. Mladší, James Tiberius, neví, co se životem a po rvačce v baru mu kapitán Pike nabízí službu u Hvězdné flotily. Nadějný, ale neposlušný kadet si najde cestu na Enterprise, která nyní, po 25 letech, zachytává stejnou anomálii, jako kdysi Kelvin. V ohrožení je nejen planeta Vulkán, ale celá budoucnost Federace.

